日本バプテスト連盟理事会は４月24日、「新天皇即位と元号改元に際しての私たちの信仰的表明」を採択した。新天皇即位に伴う関連諸行事が神道儀礼として行われ、国民に祝意を強要する形で行われることに対し反対を表明。元号改元が「天皇の在位する期間に従って、ものごとを考えるように促す」ことの強化につながることを危惧し、市民生活の中で元号使用が強要されることのないよう強く要望した。

　また、国会決議により設けられた新天皇即位に伴う「祝日」について、その趣旨が「天皇の即位に際し、国民こぞって祝意を表するため」（内閣府）と説明されていることを指摘し、「主権在民を軽視し、政教分離原則に違反して多額の国費をもって行われる一連の行事に懸念や反対を表明することは主権者である国民一人ひとりの自由の権利であり、何人も『祝意』を強要することはできません」と主張。「天皇即位の日」（５月１日）と「即位礼正殿の儀が行われる日」（10月22日）について、「連盟事務所は休日とせず、通常の業務を行う」ことを表明した。